Los biocombustibles pueden tener un rol muy diferente en la matriz energética según se trate de bioetanol, biodiésel y biometano. El bioetanol sustituye parcialmente al petróleo en el sector transporte. El biodiesel puede sustituir el consumo de petróleo y gas natural en el transporte, la generación eléctrica, la minería, la industria y así en otros consumos energéticos secundarios. En cambio, el biometano puede llegar a sustituir al petróleo, al gas natural, a la leña y al biogás; ocupándose en todas las formas de consumo secundario en la matriz energética.
